会議

閣僚級会議

• 新型インフルエンザ等対策閣僚会議
• 国際的に脅威となる感染症対策の強化のための国際連携等関係閣僚会議
• エボラ出血熱対策に関する関係閣僚会議（令和8年1月20日廃止）

有識者会議

• 新型インフルエンザ等対策推進会議
• 新型インフルエンザ等対策有識者会議（令和3年4月1日廃止）

関係省庁局長級会議

• 新型インフルエンザ等に関する関係省庁対策会議
• サル痘に関する関係省庁対策会議（令和5年5月24日廃止）
• エムポックスに関する関係省庁対策会議（令和7年9月9日廃止）

地方公共団体との会議

• 全国感染症危機管理担当部局長会議
• その他都道府県会議等（統括庁設置前）

新型コロナウイルス感染症に関する会議

• 新型コロナウイルス感染症対策本部（令和5年5月8日廃止）
• 新型コロナウイルス感染症対策の進捗に関する関係閣僚会議（令和8年1月20日廃止）
• 新型コロナウイルスに関連した感染症対策に関する関係閣僚会議（令和8年1月20日廃止）
• 新型コロナウイルス感染症対応に関する有識者会議